在临床医学和法医毒物学领域，LC-MS正被逐步应用于诸如General Unknown Screening(GUS)和Systematic Toxicological Analysis(STA)方面的宾主共栖生物的检测与鉴定。全新的LCQ Fleet在设计上突出了高灵敏度和专属性，能够在高通量、更低检出水平的情况下，获得更加精确的结果，这一特点在与Accela高速液相色谱系统联用时尤为突出。LCQ Fleet采用的智能数据相关采集技术能够进行快速化合物筛选以获得最大的结构信息。

    当分析天然产物时，传统的手段已被证明是相当耗时的。而LCQ Fleet由于具有更短的分析周期以及出色的多级质谱（MSn）特点，从而无需一个冗长的预纯化过程，就可以对已知或未知的天然产物进行快速鉴定和表征。 此外，对于要求极端苛刻的分析应用而言，Ion Max离子源可以提供出色的稳定性。而对于得到的高质量MSn数据，通过搜索对比嵌入在Mass Frontier软件中自带的或用户自定义的谱图库，即可进行化合物的鉴定并获得数据报告。

    LCQ Fleet同样可以进行旨在针对可靠序列鉴定的常规多肽鉴定，而且所获得的相关分数很高。该仪器的快速扫描能力可以分辨同一洗脱峰中的各种多肽，这种情况经常出现在复杂的蛋白酶解产物中。LCQ Fleet的操作平台是基于Windows环境下的Thermo Scientific Xcalibur软件，可提供自动化的LC-MS/MS仪器操作和快速、高效的数据采集、处理和结果输出。